教授

黄文树 教授、博士生导师、水产学院院副院长。兼任第三届农业农村部水产养殖病害防治专家委员会委员、福建省水产学会第九届理事会常务理事、第一届中国兽医协会水生动物兽医分会副会长。

联系方式：手机: 18750929001; 办公电话: 0592-6181597;

E-mail: wshuang@jmu.edu.cn

一、基本情况

1. 教育背景

1.1学历教育

1991.9.1～1995.6.30 福建师范大学  生物教育专业 理学学士；

1995.9.1～1998.6.30 福建师范大学  生物化学专业 理学硕士；导师：吴松刚教授、施巧琴教授

2001.9.1～2006.6.30 厦门大学 海洋生物学 理学博士；导师：李少菁教授、王克坚教授。获厦门大学优秀博士学位论文、福建省优秀博士学位论文三等奖

1.2其他

1999.7.17～1999.8.15 厦门大学 环境科学研究生暑期学校学习，结业；

2008.8.28～2009.1.10 上海外国语大学 出国留学人员英语高级班 结业

2018.11.2～2018.11.15 华中师范大学和大别山干部学院 全国高校教师党支部书记“双带头人”高级研修班学习，结业

2. 工作简历

2022～至今  集美大学教授 博士生、硕士生导师 研究兴趣：水生动物免疫与病害防控

2018～2022年 集美大学教授 硕士生导师 研究兴趣：水生动物免疫与病害防控技术

2010～2018年 集美大学副教授 硕士生导师。研究兴趣：鳗鲡免疫基因组学及病害防控技术；拟穴青蟹基础免疫

2009～2010年 英国Scottish Fish Immunology Research Centre，University of Aberdeen，访问学者，参与虹鳟免疫相关基因功能研究。

2003～2009年 集美大学讲师，主要研究青蟹抗菌肽Scygonadin基因的功能；研发鳗鲡细菌性疾病快速诊断试剂盒及防治药物。

2001～2006年 厦门大学 博士研究生，从锯缘青蟹性腺中分离纯化获得一种新抗菌肽，命名为Scygonadin，并阐明其基因结构，揭示其部分功能。

2000～2003年 集美大学助教，从事鳗鲡细菌性疾病快速诊断试剂盒和中西药复方防治鳗鱼疾病的科研和相关教学工作。

1998～2001年 厦门泰伦生物工程有限公司（厦门市火炬高新技术企业）工作，从事医用体外诊断试剂盒（ELISA和PCR）的生产、研发与质量管理。

1995～1998年 福建师范大学硕士生，参加国家“九五”科技攻关项目 “洗涤剂配套酶制剂——碱性脂肪酶的研究”，主要开展碱性脂肪酶产生菌扩展青霉的育种选育研究工作。

二、教学情况

承担了硕士生学位课程《水产动物病原生物学》，以及多门本科生的课程，如《水产动物疾病学》、《水产动物病理学》、《微生物学》、《水产动物疾病学实验》和《微生物学实验》等教学任务。

三、研究方向

水产动物免疫学与疫病防控

四、科研项目

1. 鳗鲡营养强化与亲本高质量培育技术 国家重点研发项目子课题 起止时间 2025～2027 （第一承担单位：中国水产科学院东海水产研究所，主持人 赵峰）

2. 日本鳗鲡I型干扰素各亚型在抗疱疹病毒感染的功能及信号转导机制 福建省自然科学基金-重点项目，起止时间：2024～2027（主持人：黄贝）

3. 日本鳗鲡两个IRF2介导的I型IFN抗病毒免疫应答调控机制的研究 国家自然科学基金面上项目，起止时间：2023～2027（主持人：黄贝）

4. 仿刺参高效养殖关键技术研究和应用 福建省省海洋与渔业局 起止时间2023～2025（第一承担单位福建省水产研究所，主持人 林琪）

5. 对虾常见疫病病原多重荧光PCR检测技术 福建佰孟医学委托项目，起止时间2023～2024

6.日本鳗鲡两个Cathelicidin抗菌肽基因的功能及机制 福建省自然科学基金-重点项目 起止时间：2021～2023.

7. 鳗鲡病原快速检测和药敏测试 福建省水产技术推广总站委托项目 起止时间：2021～2022；

8. 日本鳗鲡两个RIG-I介导的免疫识别及对I型IFN抗病毒免疫应答调控作用的研究 国家自然科学基金面上项目，起止时间：2020～2024（主持人：黄贝）

9. 河豚产毒机制及食用安全研究 福建省海洋经济创新发展区域示范专项 起止时间：2020～2022（第一承担单位：福建省水产研究所，主持人：刘智禹 教授级高工）；

10. 福建省水产养殖规范精准减量用药行动-7个水产养殖品种病原菌耐药性监测，福建省水产技术推广总站，起止时间：2019～2019；

11. 青蟹抗菌肽在发育与生殖关键过程中的生发规律及其受激素调控的分子免疫机制 国家自然科学基金-福建省人民政府促进海峡两岸科技合作联合基金（U1805233），起止时间：2018～2022（第一承担单位：厦门大学，主持人：王克坚教授）；

12. 东方魨种业创新与产业化工程，福建省海洋与渔业厅，起止时间：2018～2020 （第一承担单位：福建省水产研究所，主持人：钟建兴研究员）；

13．利用split-ubiquitin酵母双杂交系统研究日本鳗鲡TLR19配体，福建省自然科学基金项目，起止时间：2018～2020;

14．青蟹幼体发育期高死亡率的分子免疫基础，国家自然科学基金-福建省人民政府促进海峡两岸科技合作联合基金（U205123），起止时间：2013～2016（第一承担单位：厦门大学，主持人：王克坚教授）；

15．拟穴青蟹一种阴离子抗菌肽在精子和卵子成熟过程中的作用研究，国家自然科学基金（31172438），起止时间：2012～2015;

16．青蟹阴离子肽Scygonadin作用于精子成熟过程的机制研究，福建省自然科学基金（杰出青年项目2012J06008），起止时间：2012～2014;

17．斜带石斑鱼免疫/抗病相关功能基因研究，国家海洋“863”项目子课题（2012AA092201-4），起止时间：2012～2014；

18．应用RNAi技术研究锯缘青蟹雄性特异性抗菌肽scygonadin基因的功能，国家自然科学基金（30700625），起止时间：2008～2010；

19．锯缘青蟹新抗菌肽Scygonadin基因的表达特性及其功能研究，国家自然科学基金（40676083），起止时间：2007～2009（第一承担单位：厦门大学，主持人：王克坚）；

20．鳗鱼病原菌快速检测试剂盒的定型与推广，国家农业行业科研专项子项目（nyhyzx07-043-02），起止时间：2007～2010；

21．锯缘青蟹抗菌肽scygonadin基因的诱导表达机制研究，福建省自然科学基金项目（2007J0329），起止时间：2007～2009；

22．养殖鳗鲡肝脏抗菌肽的分离、纯化与鉴定，福建省科技计划项目——资助省属高校项目（2007F5079），起止时间：2007～2009；

23．锯缘青蟹抗菌肽scygonadin基因的诱导表达机制研究，厦门大学近海海洋环境科学国家重点实验室资助项目（MEL0602）, 起止时间：2007～2008（合作者 王克坚教授）；

24．养殖鳗鲡抗菌肽的初步研究，集美大学科研预研基金，起止时间：2006～2008；

25．水产养殖动物非特异性免疫因子抗菌肽的初步研究，集美大学科研启动金, 起止时间：2003～2005。

五、发表论文

1. Hou J, Li MC, Qi L, Hao W, Liu LH, Gan Z, Huang B, Huang WS, Wang L, Li L, Chen SN*, Nie P*. 2025. Genome-wide identification, expression analysis and transcriptional regulation of major histocompatibility complex class I genes in mandarin fish Siniperca chuatsi.Aquaculture 604:742455. doi.org/10.1016/j.aquaculture.2025.742455

2. Huang DN, Gao FL, Huang YX, Zheng RH, Fang C, Huang WS*, Wang KJ, Bo J*.2025. Antimicrobial activity and immunomodulation of four novel cathelicidin genes isolated from the tiger frog Hoplobatrachus rugulosus. Comparative Biochemistry and physiology C- Toxicology and Pharmacology. 289: 110091. DOI10.1016/j.cbpc.2024.110091.

3. Ji GS, Xiong J, Li DL, Xiang C, Liang Y, Huang B, Wang TH*, Huang WS*.2025. Molecular and functional characterization of a bactericidal/ permeability-increasing protein 2 (BPI2) from American eel ( Anguilla rostrata).  Aquaculture. 595: 741698. DOI10.1016/j.aquaculture.2024.741698

4. Jiao ZY, Li WX, Xiang C, Li DL, Huang WS, Nie P, Huang B*. 2024. Fish and shellfish immunology.150:109656. DOI10.1016/j.fsi.2024.109656.

5. Li WX, Wang ZX, Liang Y, Huang WS, Huang B*.2023. The origin and loss of interferon regulatory factor 10 (IRF10) in different lineages of vertebrates. Gene.854: 247083. DOI10.1016/j.gene.2022.147083

6. Li WX, Zhao GJ, Jiao ZY, Xiang C, Liang Y, Huang WS, Nie P*, Huang B*. 2023. Nuclear import of IRF11 via the importin α/β pathway is essential for its antiviral activity. Developmental and comparative immunology.141:104649. DOI10.1016/j.dci.2023.104649

7. Liang Y*, Liu HZ, Zhai SW, Huang LX, Huang WS, Huang B, Xu JS, Xiong J, Wang B. 2023. Effects of weaning American glass eels (Anguilla rostrata) with the formula diet on intestinal microbiota and inflammatory cytokines genes expression.Heliyon,9(6): e16965. DOI10.1016/j.heliyon.2023.e16965

8. Li YH*, Kwan KY, Li SS, Liu YC, Weng BS, Huang WS, Weng ZH.2022. Transcriptome analysis of the digestive tract of Tachypleus tridentatus and Carcinoscorpius rotundicauda. Journal of Ocean University of China. 21(3):591-600. DOI: 10.1007/s11802-022-5321-7

9. Qiao K, Jiang CY, Xu M, Chen B, Qiu WH, Su YC, Hao H, Lin ZY, Cai SL, Su Jie, Liu ZY*, Huang WS*. 2021. Molecular characterization of the von willebrand factor type D domain of vitellogenin from Takifugu flavidus. Marine Drugs. 19(4):e181. DOI: 10.3390/md19040181

10. Liang Y, Liu HZ, Li X, Huang WS, Huang B. Xu JS, Xiong J, Zhai SW. 2021. Molecular insight, expression profile and subcellular localization of two STAT family members, STAT1a and STAT2, from Japanese eel, Anguilla japonica. Gene. 769:e145257. DOI: 10.1016/j.gene.2020.145257

11. Li WX, Ling LL, Wang ZX, Liang Y, Huang WS, Nie P, Huang B. 2021. Functional domains and amino acid residues of Japanese eel IRF1, AjIRF1, regulate its nuclear import and IFN/Mx promoter activation. Developmental and Comparative Immunology. 116: e103923. DOI:10.1016/j.dci.2020.103923

12. Xiong J, Wu SG, Liang Y, Zou YL, Xie XM, Huang WS*, Zhang YB. 2020. Visual closed-tube loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay targeting aerolysin gene: a practical screening method for virulent Aeromonas species affecting cultured eels in China. Aquaculture International. 28(6):2319-2332. DOI: 10.1007/s10499-020-00588-z

13. Xiong J, Huang B, Xu JS, Huang WS*. 2020. A closed-tube Loop-Mediated Isothermal Amplification Assay for the visual detection of Staphylococcus aureus. Applied Biochemistry and Biotechnology.191(1) SI:201-211 DOI:10.1007/s12010-020-03278-x

14. Huang B, Li WX, Wang ZX, Liang Y, Huang WS, Nie P*. 2020.Identification of a novel splice variant isoform of interferon regulatory factor 10, IRF10, in orange spotted grouper Epinephelus coioides. Fish & Shellfish Immunology.97: 637-647. DOI:10.1016/j.fsi.2019.12.056

15. Huang B, Wang ZX, Zhang C, Zhai SW, Han YS, Huang WS, Nie P*. 2019. Identification of a novel RIG-I isoform and its truncating variant in Japanese eel, Anguilla japonica. Fish & Shellfish Immunology.94: 373-380 DOI: 10.1016/j.fsi.2019.09.037

16. Xiong J, Huang B, Guo SL, Xu JS, Huang WS*. 2019. A novel multiplex PCR assay for rapid detection of virulent Aeromonas in cultured eels. Journal of Applied Microbiolgy. 127(2):418-428.DOI: 10.1111/jam.14311

17. Huang B, Wang ZX, Liang Y, Zhai SW, *Huang WS, *Nie P. 2019. Identification of four type I IFNs from Japanese eel with differential expression properties and Mx promoter inducibility. Developmental and Comparative Immunology. 91: 62-71.DOI: 10.1016/j.dci.2018.09.012

18. Huang WS, Wang ZX, Liang Y, Nie P, *Huang B. 2018. Characterization of MyD88 in Japanese eel, Anguilla japonica. Fish & Shellfish Immunology.81:374-382. DOI:10.1016/j.fsi.2018.07.028

19. Huang WS, Zhu MH, Chen S, Wang ZX, Liang Y, *Huang B, *Nie P. 2016. Molecular cloning and expression analysis of a fish specific interferon regulatory factor, IRF11, in orange spotted grouper, Epinephelus coioides. Fish & Shellfish Immunology, 60:368-379.

20. Chen SN, Zhang XW, Li L, Ruan BY, Huang B, Huang WS, Zou PF, Fu JP, Zhao, LJ,Li N, *Nie P. 2016. Evolution of IFN-lambda in tetrapod vertebrates and its functional characterization in green anole lizard (Anolis carolinensis). Developmental and Comparative Immunology. 61:208-224.

21. Qiao K, Xu WF, Chen HY, Peng H, Zhang YQ, Huang WS, Wang SP, An Z, Shan ZG, Chen FY, *Wang KJ. 2016. A new antimicrobial peptide SCY2 identified in Scylla paramamosain exerting a potential role of reproductive immunity. Fish & Shellfish Immunology, 51: 251-262.

22. *Huang WS, Duan LP, Huang B, Wang KJ, Zhang CL, Jia QQ, Nie P, *Wang T. 2016. Macrophage migration inhibitory factor (MIF) family in arthropods: Cloning and expression analysis of two MIF and one D-dopachrome tautomerase (DDT) homologues in mud crabs, Scylla paramamosain. Fish & Shellfish Immunology, 50:142-149.

23. * Wang T, Secombes CJ, Johansson P, Abós B, Holt A, Tafalla C, Jiang Y, Wang A, Xu Q, Qi Z, Huang W, Costa MM. et al. 2016. First in-depth analysis of the novel Th2-type cytokines in salmonid fish reveals distinct patterns of expression and modulation but overlapping bioactivities. Oncotarget, 7(10):1-30.

24. *Huang WS, Duan LP, Huang B, Zhou LH, LiangY, Tu CL, Zhang FF, Nie P, Wang TH. 2015. Identification of three IFN-gamma inducible lysosomal thiol reductase (GILT)-like genes in mud crab Scylla paramamosain with distinct gene organizations and patterns of expression. Gene, 570(1):78-88.

25. Huang B, Jia QQ, Liang Y, Huang WS, *Nie P. 2015. Interferon regulatory factor 10 (IRF10): Cloning in orange spotted grouper, Epinephelus coioides, and evolutionary analysis in vertebrates. Fish & Shellfish Immunology, 46: 669-677.

26. Huang L, Qin Y, *Yan Q, Lin G, Huang L, Huang B, Huang W. 2015. MinD plays an important role in Aeromonas hydrophila adherence to Anguilla japonica mucus. Gene, 565(2): 275-281.

27. Qin Y, Lin G, Chen W, Huang B, Huang WS, *Yan Q. 2014. Flagellar motility contributes to the invasion and survival of Aeromonas hydrophila in Anguilla japonica macrophages. Fish & Shellfish Immunology, 39(2): 273-279.

28. Liang Y, *Guan RZ, Huang, Wen S. 2014. Effect of pH on separation performances in High-Performance Liquid Chromatography of antibacterial peptides from the spleen of Japanese eel, Anguilla japonica. Separation Science and Technology, 49(7): 1045-1052.

29. Huang B, Huang WS, *Nie P. 2014. Cloning and expression analyses of interferon regulatory factor (IRF) 3 and 7 genes in European eel, Anguilla anguilla with the identification of genes involved in IFN production. Fish & Shellfish Immunology, 37(2): 239-247.

30. Zhang DL, *GuanRZ, Huang WS, Xiong J. 2013. Isolation and characterization of a novel antibacterial peptide derived from hemoglobin alpha in the liver of Japanese eel, Anguilla japonica. Fish & Shellfish Immunology, 35(3): 625-631.

31. Huang B, Huang WS, *Nie P. 2013. Characterization of four Mx isoforms in the European eel, Anguilla anguilla. Fish & Shellfish Immunology, 35(3):1048-1054.

32. Wang TH, Huang WS, Costa MM, *Secombes CJ. 2011. The gamma-chain cytokine/receptor system in fish: more ligands and receptors. Fish & Shellfish Immunology. 31(5):673-687.

33. Xu WF, Qiao K, Huang SP, Peng H, Huang WS, Chen FY, Zhang N, Wang GZ, *Wang KJ. 2011. The expression pattern of scygonadin during the ontogenesis of Scylla paramamosain predicting its potential role in reproductive immunity.  Developmental and Comparative Immunology. 35(10):1076-1088.

34. Xu WF, Qiao K, Huang SP, Peng H, Huang WS, Chen FY, Bo J, *Wang KJ. 2011. Quantitative gene expression and in situ localization of scygonadin potentially associated with reproductive immunity in tissues of male and female mud crabs, Scylla paramamosian. Fish & Shellfish Immunology. 31(2):243-251.

35. Wang TH, Huang WS, Martin SAM, *Secombes CJ. 2011. Two copies of the genes encoding the subunits of putative interleukin (IL)-4/IL-13 receptors, IL-4Rα, IL-13Rα1 and IL-13Rα2, have been identified in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) and have complex patterns of expression and modulation. Immunogenetics. 63: 235-253.

36. Wang T, Huang W, Costa MM, *Secombes CJ. 2011. The gamma-chain cytokine/receptor system in fish: More ligands and receptors. Fish & Shellfish Immunology. 31: 673-687.

37. *Guan RZ, Xiong J, Huang WS, Guo SL. 2011. Enhancement of protective immunity in European eel (Anguilla anguilla) against Aeromonas hydrophila and Aeromonas sobria by a recombinant Aeromonas outer membrane protein. Acta Biochimica et Biophysica Sinica, 43:79-88.

38. Liang Y, *Guan RZ, Huang WS, Xu TL. 2011. Isolation and identification of a novel inducible antibacterial peptide from the skin mucus of Japanese eel, Anguilla japonica. Protein Journal. 30(6):413-421.

39. Wang TH, Monte MM, Huang WS, Boudinot P, Martin SAM, *Secombes CJ. 2010. Identification of two FoxP3 genes in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) with differential induction patterns. Molecular Immunology, 47:2563-2574.

40. Peng H, Yang M, Huang WS, Ding J, Qu HD, Cai JJ, Zhang N, *Wang KJ. 2010. Soluble expression and purification of a crab antimicrobial peptide scygonadin in different expression plasmids and analysis of its antimicrobial activity. Protein Expression and Purification, 70(1):109-115.

41. *Wang KJ, Huang WS, Yang M, Chen HY, Bo J, Li SJ, Wang GZ. 2007. A male-specific expression gene, encodes a novel anionic antimicrobial peptide, Scygonadin, in Scylla serrata. Molecular Immunology, 44: 1961-1968.

42. Huang WS, *Wang KJ, Yang M, Cai JJ, Li SJ, Wang GZ. 2006. Purification and part characterization of a novel antibacterial protein Scygonadin, isolated from the seminal plasma of mud crab, Scylla serrata (Forskål, 1775). Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 339: 37-42.

43. 胡振辉, 薛凌展, 胡振禧, 陈度煌, 陈永兴, 陈须坤, 吴斌, 黄文树*. 2025. 马口鱼全人工规模化繁育技术. 科学养鱼(2):18-20. 10.14184/j.cnki.issn1004-843x.2025.02.012

44. 杨紫涵，蔡水淋，许旻，乔琨，陈贝，田盟盟，黄文树，刘智禹*. 2024 .产河豚毒素微生物的研究进展.  46 (04): 403-412.

45. 周晓玲, 李东利, 黄文树, 黄贝*. 2024. 日本鳗鲡心脏细胞系的建立及其在鳗鲡免疫应答研究中的应用. 水生生物学报.48(11):1884-1892.

46. 邹文政, 黄文树, 李忠琴*, 杨求华, 张光明.2024. 二株石斑鱼源芽孢杆菌的生物学特征与益生性研究 海洋与湖沼.55(3):775-786.

47. 李忠琴, 王泽楠, 黄文树, 杨求华, 邹文政*. 2024. 仿刺参(Apostichopus japonicus)肠道源植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum) HY21 的生长及益生特性分析. 微生物学报2024, 64(3): 840–853. DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20230549

48. 赵歌洁, 黄贝, 黄文树*. 2024. 日本鳗鲡TBK-1基因的克隆及免疫刺激的表达模式. 集美大学学报(自然科学版) . 2024 ,29 (01):1-9.  10.19715/j.jmuzr.2024.01.01

49. 郑圣怡, 潘南, 陈晓婷, 吴靖娜, 蔡水淋, 黄文树, 刘智禹. 2023.鱼油的绿色制备工艺、标准规范及营养功效研究进展. 中国油脂.48(07):8-16. 10.19902/j.cnki.zgyz.1003-7969.220275.

50. 黄丹妮, 章敏, 高富龙, 郑榕辉, 黄文树, 薄军, 方超. 2023. 生物可降解微纳米塑料生物毒性效应的研究进展与展望. 生态毒理学报.18(3):175-201.

51. 凌露露, 梁英, 黄文树, 聂品, 黄贝*. 2023.日本鳗鲡TRAF3基因的克隆及功能研究. 水产学报. 47(8): 089414.

52. 蒋彩云，乔琨，许旻，陈贝，刘智禹，黄文树*. 2021. 菊黄东方魨卵黄蛋白原肽段vWD真核重组表达及功能研究. 集美大学学报(自然科学版) .26(04): 299-305.

53. 李文星，郑妨，凌露露，梁英，黄文树，聂品，黄贝*. 2021. 日本鳗鲡STAT3及其剪切异构体的克隆、亚细胞定位及功能分析. 水产学报. 45(9):1517-1529.

54. 武亚方，黄文树，段明珠，李文星，熊静，梁黄，黄贝*.2020. 日本鳗鲡巨噬细胞移动抑制因子的基因鉴定及表达分析. 水产学报. 44(9):1549-1560.

55. 蒋彩云，乔琨，许旻，熊静，刘智禹*，黄文树*. 2020. 利用RT-qPCR技术筛选菊黄东方魨的最适内参基因. 渔业研究. 42(02):105-116.

56. 李想，黄文树，黄贝，徐继松，翟少伟，梁英*，张婉婷，刘海姿. 2019. 日本鳗鲡Ⅱ型干扰素基因（IFN-γ和IFN-γrel）的原核表达与纯化研究. 海洋渔业. 41(05):567-577.

57. 张财亮，黄贝，熊静，陈芳奕，黄文树*. 2019. 拟穴青蟹两个Crustin新变体的克隆表表达分析. 厦门大学学报（自然科学版）. 58(04):505-515.

58. 王佩，段明珠，黄贝，熊静，梁英，黄文树*. 2019. 日本鳗鲡抗菌蛋白BPI基因的克隆、鉴定与表达. 集美大学学报(自然科学版) .24(02): 81-93.

59. 王晓飞，彭会，陈芳奕，张财亮，黄文树*. 2019. 拟穴青蟹抗菌肽Crustin新变体的表达特性与抗菌功能. 厦门大学学报（自然科学版）. 58 (03):358-365.

60. 陈姗，张芳芳，黄贝，*黄文树. 2018. 日本鳗鲡r-干扰素诱导的溶酶体巯基还原酶（GILT）基因的克隆鉴定与表达分析. 厦门大学学报（自然科学版）.57(4):484-493.

61. 贾芹芹，黄贝，段利朋，熊静，徐继松，聂品，黄文树.2017. 斜带石斑鱼干扰素调节因子8基因的鉴定与表达模式分析. 厦门大学学报（自然科学版）.56(2):178-187.

62.李春艳，黄贝，熊静，彭喜霞，梁英，*聂品，*黄文树.2017. 日本鳗鲡TLR21基因的鉴定、免疫应答与启动子分析.水生生物学报. 41(2):296-305.

63. 彭喜霞，黄贝，段利朋，李春艳，梁英，*聂品，*黄文树. 2017.日本鳗鲡IFN-r基因的鉴定、表达模式及启动子活性分析.水生生物学报.41(3):589-602.

64. 熊静, 赖晓健, 余钦, 郭松林, 徐继松, *黄文树. 2017. 7株鳗鲡致病性气单胞菌毒力基因胞外产物及其活性比较. 华中农业大学学报. 36(1):76-85.

65. 段明珠, 黄贝, 梁英, 张芳芳, 聂品, *黄文树. 2016. 日本鳗鲡肝脏表达抗菌肽2基因的克隆与表达. 水生生物学报. 40(2): 252-260.

66. 张芳芳, 熊静, 段明珠, 李春艳, 彭喜霞, *黄文树. 2015. 日本鳗鲡COX-2基因的克隆、鉴定及表达分析. 集美大学学报(自然科学版) (05): 321-332.

7. 段利朋, 黄贝, 周立红, 梁英, 聂品, *黄文树. 2015 拟穴青蟹两种新C-型凝集素基因的克隆与表达分析. 水生生物学报.39 (02): 321-330.

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72. 张东玲, *关瑞章, 黄文树, 熊静, 徐继松, 宋宝东. 2013. pH和色谱柱对日本鳗鲡肝脏抗菌肽分离纯化效果的影响及抗菌活性检测. 水产学报. (04): 614-621.

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80. 李岑鹏, *关瑞章, 江兴龙, 陈学豪, 周立红, 黄文树. 2009. 循环水处理系统处理鳗鲡养殖污水的应用实验. 集美大学学报（自然科学版）, 14(2):126-130.

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89. *关瑞章, 张雅芝, 纪荣兴, 黄文树. 2007. 浅议我国水产类本科教育的深化改革.集美大学学报, 8(2): 59-62.

90. 姜永华，张春晓，黄文树，谢仰杰, 孙云章, 黄力行, 邹鹏飞, 李丹.2024. 新农科水产创新人才的创新创业教育路径探析与实践——以集美大学为例高等农业教育. (05) : 22-28. 10.13839/j.cnki.hae.2024.5.003

六、专利授权

1. 黄文树、汲广硕、熊静、黄贝、梁英、王曦。 美洲鳗鲡抗菌肽的体外重组表达及鉴定. ZL202210706135.4 授权发明专利 2024-09-24

2. 姜永华、钟照威、王艺磊、张子平、黄文树、冯燕。 一种大黄鱼体外诱导多能性干细胞的方法 ZL 202210192217.1授权发明专利 2023-11-21

3. 熊静，黄文树，黄贝，徐继松，梁英。基于LAMP法检测含Aer基因的气单胞菌的引物组及其应用. ZL202010151499.1 授权发明专利2022-08-16

4. 熊静，黄文树，徐继松。一种可同时检测气单胞菌7个毒力基因的多重PCR方法。ZL201910047451.3 授权发明专利2022-02-22

5. 黄文树，熊静，徐继松，王闻雨，黄贝，梁英，邹鹏飞。一种环介导等温扩增法检测对虾白斑综合症病毒的方法。ZL201710676034.6 授权发明专利2020-06-19

6. 熊静，黄文树，徐继松，赖晓健，刘爱原。闭管可视化鳗源嗜水气单胞菌环介导等温扩增检测方法。ZL201710676559.X 授权发明专利2020-08-25

7. 熊静，黄文树，赖晓健，徐继松。检测实验动物金黄色葡萄球菌的gyrB引物组合。ZL201610139846.2授权发明专利2019-03-05

8. 王克坚，黄文树，李少菁，王桂忠。锯缘青蟹抗菌肽及其基因和基因的克隆方法。ZL200510053239.6 授权国家发明专利

9. 郭松林，关瑞章，王玉，冯建军，林鹏，黄文树.一种鳗鲡嗜水气单胞菌和迟钝爱德华氏菌二联重组蛋白及其制备方法。ZL201210433570.0 授权发明专利2015-08-12

七、国际学术交流与合作

2009.7～2010.6在英国阿伯丁大学（Scottish Fish Immunology Research Centre, School of Biological Sciences, University of Aberdeen）的Christopher J. Secombes 教授指导下从事鱼类免疫基因的研究。

八、获奖情况

1. 名优水产减细菌病精准诊断与绿色防控关键技术创建与产业化应用 福建省科技进步奖三等奖（第3完成人） 颁奖单位：福建省人民政府 2025.01.24

2. 青蟹新型抗菌肽Scygonadin的分离鉴定、免疫机制和功能研究 国家海洋科学技术奖二等奖（第2完成人），颁奖单位：国家海洋局 2013.5.31

3. 室内循环水鳗鲡苗种培育技术 福建省科技进步奖三等奖（排名第4） 颁奖单位：福建省人民政府 2009.11

4. 海水养殖病害病原检测及防治的开发研究 海洋创新成果奖二等奖（排名第9），颁奖单位：国家海洋局2006.1.18